正常的施量是不會傷植物的根部的。但是，有機肥施多了會燒根。有機肥已經發酵了很長時間了，其中的無機鹽類含量已經不低了，所以施肥多了，肯定會使得根部離子濃度過高，出現燒根現象。但是不會出現燒死植物的現象，其因有二：
一、河北有機肥肥效穩定溫和，對土壤的溶液度改變相對緩慢不會造成植物脫水死亡；
二、有機肥經過高溫腐熟發酵處理，施于土壤不像未經處理的農家肥會作嘔發酵，腐爛植物的根須。
萬一施量多了，那該怎么處理呢？
1.應加強通風，避免氣害蔓延有機肥在腐熟的過程中產生的氨氣揮發不出去，很容易熏壞蔬菜。因此，出現熏苗現象時，應增加放風次數和時間，以便把棚內的氨氣及時排出棚外，避免氣害的發生。
2.增施養根護根的肥料隨水沖施養根護根的功能性產品，既能夠降低未腐熟有機肥對根系造成的影響，同時像生物菌肥這樣的功能性肥料可抑制根部病害的侵染。
有機肥的優點是含營養元素種類多，包括大量、微量各種營養元素，并含有大量的有機物、維生素等活性物質。
常年施用有機肥能使土壤有機質得到更新或提高，改土壤理化性狀，明顯提高土壤質量。但其缺點是養分含量低，而且養分形態主要呈有機態，需要經過土壤微生物逐步分解，才能轉化成植物可以吸收利用的形態，因此養分供應強度低，難以滿足高產作物快速生長期的需要。
在施用上，要考慮到有機肥種類多、特點不一的特性，不僅相互間搭配還要與適量化肥搭配施用。以畜禽養殖業所產生的廢棄物來說，這類有機肥的數量很大，隨著畜禽產品生產的快速發展而增長得極快，如果不花大力氣對畜禽糞便進行科學處理和施用，不僅會造成蔬菜、果樹以及煙葉、茶葉、馬鈴薯等眾多經濟作物失去大批量價廉物美的肥料資源，還會降低這類農產品的產量和品質，進而會造成農區環境惡化，不利于新農村建設。所以，首當其沖地要在經濟類作物生產中，充分開發和合理施用糞尿類有機肥源。由于糞尿類有機肥的主要特點是養分含量高于其它有機肥，但是其碳氮比（C/N）范圍比較窄，一般在6～10之間，為此，要添加部分粉碎的秸稈組成混合有機肥施用。這樣既可實現農村環境的清潔化又可保證果蔬類農產品的質量和安全性。施用糞尿類有機肥可以部分地替代化學肥料對作物的氮磷養分供給，從而減少化肥的施用量，提高化肥利用率。
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